當前相當多的肥料使用者，包括很多經銷商，對氯基復合肥存在誤解。由于人們無法知道肥料中氯離子的含量究竟有多少。所以，在蔬菜、果樹等作物上面，一律談“氯”色變，片面選擇、推薦硫基復合肥，造成種植成本增加。
有些植物對氯離子非常敏感，當吸收量達到一定程度，會明顯地影響產量和品質，通常稱這些植物為忌氯作物。氯離子較多時，不利于糖轉化為淀粉，塊根和塊莖的淀粉含量會降低；氯離子能促進碳水化合物的水解降低含糖量；氯離子多，會影響煙草的燃燒性，卷煙易熄火；氯離子多時，常對敏感作物幼苗造成危害。氯對茄科作物會產生不利影響。有些作物使用含氯肥料，只是影響口感并不影響產量，并非所有蔬菜和果樹都不可使用含氯復合肥。
耐氯能力強的作物土壤氯濃度大于600毫克/1公斤條件下能正常生長的作物。如：水稻、棉花、紅麻、菠菜、甜菜、高粱、谷子等。
耐氯能力中等的作物土壤氯濃度大于300～600毫克/公斤條件下能正常生長的作物。如：小麥、油菜、玉米、大豆、蠶豆、豌豆、甘蔗、花生、番茄、黃瓜、蘿卜等。
耐氯能力弱的作物只能適應土壤氯濃度小于300毫克/公斤條件下能正常生長的作物。如：馬鈴薯、西瓜、柑橘、茶葉、辣椒、筧菜、葡萄等在土壤含氯小于50毫克/公斤的地區，這類作物可以適量使用氯化鉀，含氯的低氯肥料。萵筍、白菜、甘薯、烤煙、草莓、蘋果、幼樹為忌氯作物，最好不用氯化銨等含氯化肥。
實踐證明，除了煙草，某些特殊作物以外，低氯復混肥完全可以適應大多數果樹、蔬菜要求。使用低氯復混肥，可以有效降低投入成本，而不會對品質造成明顯影響，而且提高產量。
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